Archivio storico delle Elezioni Amministrative di Favignana a partire dal 1993, anno di introduzione dell'elezione diretta del sindaco con la Legge n.81 del 25 marzo 1993. Sindaci eletti e liste politiche di appartenenza.
Il 25 e 26 maggio 2025 i cittadini di Favignana sono stati chiamati alle urne per le elezioni comunali 2025. È stato eletto il sindaco Giuseppe Pagoto (52 anni) con la lista Movimento per le Egadi - Pagoto Sindaco.
Il 4 e 5 ottobre 2020 si sono tenute le elezioni comunali 2020. È stato eletto il sindaco Francesco Forgione (60 anni) con la lista Vivere le Egadi Forgione Sindaco.
Con D.P. n.531/GAB del 12 marzo 2025 il Presidente della Regione Siciliana ha decretato la cessazione del Sindaco e della Giunta e contestualmente disposto lo scioglimento del Consiglio comunale ed ha nominato un commissario straordinario in sostituzione degli organi decaduti fino alla prima tornata elettorale utile.
Il 10 giugno 2018 hanno avuto luogo le elezioni comunali 2018. È stato riconfermato il sindaco Giuseppe Pagoto (45 anni) con la lista Per le Egadi Pagoto Sindaco.
Il 9 e 10 giugno 2013 si sono svolte le elezioni comunali 2013. È stato eletto il sindaco Giuseppe Pagoto (40 anni) con la lista Egadi in Movimento Pagoto Sindaco.
Il 15 e 16 giugno 2008 si è votato per le elezioni amministrative ed è stato eletto il sindaco Lucio Antinoro (49 anni) con una lista civica.
Il 25 e 26 maggio 2003 si sono tenute le elezioni amministrative ed è stato eletto il sindaco Gaspare Ernandez (44 anni) con la lista Forza Italia. Il 20 marzo 2008 Gaspare Ernandez si è dimesso dalla carica di sindaco.
Il 24 maggio 1998 hanno avuto luogo le elezioni amministrative ed è stato eletto il sindaco Giuseppe Ortisi (42 anni) con la lista PDS.
Il 12 giugno 1994 si sono svolte le elezioni amministrative ed è stato eletto il sindaco Giuseppe D'Asta (59 anni) con una lista civica.